После основания герцогства и университета в 16-м веке Кёнигсберг стал привлекать учёных, проповедников и деятелей искусства. Впоследствии здесь творили известные учёные, в особенности теоретики государства и права, а также естествоиспытатели. На их фоне и по сей день выделяется Иммануил Кант как один из самых значительных философов в мире.
Однако, наиважнейшее научное открытие этой страны было совершено Николаем Коперником не в Кёнигсберге, а в Алленштайне и Фрауэнбурге. Он покончил со средневековым мировоззрением, согласно которому всё во вселенной вращалось вокруг земли.
Астрономия оставалась основным научным направлением в Кёнигсберге с его обсерваторией и важными математическими работами по движению небесных тел. Иммануил Кант тоже проводил исследования по астрономии наряду со своими философскими работами.
В период кризиса Пруссии, вызванного французской оккупацией в 1807-1813 гг., такие ученики кёнигсбергских просветителей как Теодор фон Шён или Фридрих Леопольд фон Шрёттер смогли осуществить свои реформаторские идеи и коренным образом модернизировать всю Пруссию.
Небольшая выборка известных профессоров:
Симон Дах
Христиан Якоб Краус
Карл Лахманн
Эдуард фон Симсон
Андреас Озиандер,
Иоганн Фридрих Гербарт (1776-1841): философ, психолог и педагог
Йоганнес Фогт (1786-1863): архивариус и историк
Феликс Дан
Адальберт Беценбергер (1851-1922): филолог, специалист по балтийским языкам
Герман фон Гельмгольц
Небольшая выборка известных студентов:
Иоганн Кристоф Готшед
Давид Гильберт
Теодор Готлиб фон Гиппель старший
Теодор Готлиб фон Гиппель младший
Иоганн Георг Гаман
Иоганн Готфрид Гердер
Э.T.A. Гофман
Фердинанд Грегоровиус
Густав Роберт Кирхгофф
Герман Минковски
Арнольд Зоммерфельд
Герман Зудерман
Эрнст Вихерт